Lancé en 1992, le S 309 HD est le plus petit autocar de la gamme TopClass 300 du constructeur Setra. Il est le successeur du S 209 HD. De 1992 à 1994, ce véhicule est assemblé au Danemark, dans l'usine Aabenraa Karrosseri appartenant depuis 1988 à Kässbohrer. Deux-cents exemplaires y seront produits avant le transfert de l'assemblage en Allemagne.
L'aménagement intérieur est personnalisable. Un salon peut être aménagé à l'arrière.
Destiné au transport occasionnel de petits groupes, cet autocar a aussi été utilisé pour du transport régulier. Trois S 309 HD de la société Cars de Bordeaux ont circulé sur la navette entre la gare SNCF de Bordeaux et l'aéroport Bordeaux-Mérignac.
Les derniers exemplaires ont été livrés en 2002. Durant 10 ans, cet autocar aura été produit à près de 600 exemplaires. Son successeur s'appelle S 411 HD.